E-HIV tegevust korraldab noukogu.
Nõukogu esimees – Irja Lutsar, professor, TÜ mikrobioloogia instituudi juhataja, Eesti Infektsioonhaiguste Seltsi juhatuse liige
Nõukogu aseesimees – Kai Zilmer, MD, Lääne-Tallinna Keskhaigla nakkuskliiniku juhataja, Eesti Infektsioonhaiguste Seltsi juhatuse liige
Nõukogu liikmed:
Matti Maimets, dotsent, TÜ nakkusosakonna juhataja
Kersti Kink, MD, Lääne-Tallinna Keskhaigla nakkuskliiniku ambulatoorse osakonna juhataja
Svetlana Semjonova, MD, Ida-Viru Keskhaigla infektsioonhaiguste osakonna infektsionist
Kaisa Kirs, MD, Lääne-Tallinna Keskhaigla diagnostikakliiniku mikrobioloogia osakonna vastutav arst